Menelisik sejarah Desa Klokah, memang secara ilmiah sampai saat ini belum ada bukti yang akurat tentang awal mula terbentuknya Desa Klokah. Menurut sumber-sumber secara lisan dari leluhur terdahulu, disebutkan bahwa Desa Klokah sebelum tahun 1910-an dulunya terdiri gabungan dari 2 Desa, yaitu Desa Klokah dan Desa Pacing yang sekarang menjadi salah satu Dusun di Desa Klokah.
Sebelum adanya penggabungan, Desa Klokah terdiri dari Dusun Klokah, Dusun Klokah Etan, Dusun Brabo dan Dusun Jegur. Sedangkan Desa Pacing meliputi Dusun Pacing, Dusun Jipangan dan Dusun Ngrapah.
Hingga saat ini Desa Klokah terdiri dari 7 Dusun yaitu :
- Jegur
- Klokah
- Klokah Etan
- Brabo
- Pacing
- Jipangan
- Ngrapah